新的世界地质公园申请和再评估工作的决策机构，负责就世界地质公园活动的战略规划和实施问题向联合国教科文组织总干事提出建议。
理事会由十二名常任成员构成，常任成员拥有表决权，是联合国教科文组织总干事根据世界地质公园网络和会员国的推荐而任命的个人。此外，联合国教科文组织总干事、世界地质公园网络主席、国际地质科学联合会秘书长、国际自然保护联盟总干事或者他们的代表是理事会的当然成员，但没有表决权。
自2015年以来，经中国政府组织推荐，我国有两位科学家先后被联合国教科文组织总干事任命为理事会成员。现任理事会成员张建平教授于2018年经国家林业和草原局推荐进入理事会，并被选举为理事会副主席。
